GWAS过滤加速疾病研究

约翰霍普金斯遗传医学研究所的遗传学研究团队利用全基因组关联研究解决了研究人员面临的困境，他们开发了一种新的方法，战略性地“过滤”哪些基因值得进一步研究。研究人员希望这一策略能够加速帕金森病、阿尔茨海默病、精神分裂症甚至成瘾的研究，帮助研究人员避免“死路一条”。他们乐观地认为，这一策略将被广泛使用，并节省研究人员的时间和金钱。

研究结果发表在3月1日的《美国人类遗传学杂志》上。

GWAS确定了基因组中可能包含数百个可能受突变影响的基因的区域。从这些广泛的列表中选择要研究的基因是非常投机的。科学家说，最接近突变的基因甚至在受疾病影响的细胞类型中发挥作用的可能性最多只有50%。

助理主任安迪麦卡里昂博士说：“我们的情况是，我们可以利用GWAS收集大量的基因数据，但他们意识到它无法提供我们理解结果所需的生物学背景。约翰霍普金斯大学医学院人类遗传学研究生课程和分子与比较病理生物学副教授。

McCallion理解所有这些数据的策略集中在使用单细胞RNA-seq分析受疾病影响的细胞中的活性基因、相互作用的基因组、它们对突变的易感性以及过去科学研究的信息，以过滤掉更多的信息，在任何涉及的领域中，只有少数候选基因有患病的风险。

研究人员专注于影响大脑多巴胺神经元的帕金森病。麦卡里昂说，GWAS确定了49个与帕金森病相关的突变基因组。利用这种策略，他和他的团队可以将这些部分的数千个基因过滤到每个区域平均两个。

然后，研究人员询问他们发现的基因是否包括先前发现的导致帕金森病的基因。在存在于指定区域的帕金森病相关基因中，该策略捕获除一个基因外的所有基因。“然而，我们没有捕捉到的一个在多巴胺能神经元中没有表达，”麦卡里昂解释道。“这让我们相信，其他指向的基因对这种疾病很重要。”

研究人员希望以同样的方式研究帕金森病和其他神经系统疾病的生物学背景。他们计划调查年龄、环境和疾病状态是否会进一步磨砺帕金森病的过滤器。